AFDS có nhiều chủng loại máy bay tha hồ cho người chơi lựa chọn và một loạt các nhiệm vụ hấp dẫn. Tuy nhiên, không giống như các phần trước, AFDS có tất cả dàn nhân vật kiểu anime mới được minh họa bởi Tsukasa Jun. Một số có thể được chơi như và những người khác chỉ để hỗ trợ. Mỗi nhân vật có một lựa chọn máy bay duy nhất để tiến hành phi vụ và có một loạt màn chơi khác nhau để hoàn thành. Hoàn thành một số màn chơi này sẽ mở ra các màn chơi bí mật và máy bay ẩn cho lần chơi lại. Sau khi trò chơi được hoàn thành một lần, một nhà chứa máy bay bí mật trở nên có sẵn. Khi trò chơi được hoàn thành và giành được huy chương, nhiều máy bay bí mật trở nên khả dụng hơn.